Las instalaciones de WordPress Multisite que estén configuradas para mostrar los sitios como subdirectorios pueden dar error en un servidor funcionando con Apache 2.4 y PHP-FPM 5.6. Cuando se visita el panel de administración de cualquier sitio que no sea el principal: File not found.
Si se consulta el log de FPM se verán multitud de respuestas 404. Y si se consulta el log de Apache se encontrarán errores de este tipo: Got error 'Primary script unknown'
Para solucionarlo hay que modificar ligeramente la configuración de Apache. La siguiente línea configura la conexión con FPM:
ProxyPassMatch ^/(.*\.php(/.*)?)$ unix:/ruta/hasta/el/php5-fpm.socket.sock|fcgi://localhost/ruta/hasta/el/hroot/
Hay que añadir otra regla (antes que la anterior) para cubrir el caso de los sitios secundarios del Multisite:
ProxyPassMatch ^/([_0-9a-zA-Z-]+/)?(wp-(content|admin|includes)/.*\.php(/.*)?)$ unix:/ruta/hasta/el/socket.sock|fcgi://localhost/ruta/hasta/el/hroot/$2
Aunque esta solución funciona sigue arrojando los mismos errores, así que yo prefiero eliminar la configuración de FPM mediante ProxyPassMatch e incluir un handler dentro del entorno Directory. Así:
<Directory "/ruta/hasta/el/hroot">
# otras configuraciones
<FilesMatch \.php$>
SetHandler "proxy:unix:/ruta/hasta/el/socket.sock|fcgi://localhost"
</FileMarch>
</Directory>